Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm18016-201ENSMUST00000216119 801 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC137961.1-201ENSMUST00000227924 734 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Tlr6-201ENSMUST00000062315 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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Rabgef1Q9JM13 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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