Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC126690.1-201ENSMUST00000228898 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr653-202ENSMUST00000215585 4765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr653-203ENSMUST00000217466 4786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr1226-206ENSMUST00000217601 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Ear-ps3-201ENSMUST00000168308 445 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm17916-201ENSMUST00000186137 1342 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr1178-202ENSMUST00000214040 6480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RabggtaQ9JHK4 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms