Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Cldn12Q9ET43 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm23264-201ENSMUST00000083372 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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Cldn12Q9ET43 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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Cldn12Q9ET43 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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Cldn12Q9ET43 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm24787-201ENSMUST00000157380 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Cldn12Q9ET43 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms