Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 1700074H08Rik-201ENSMUST00000189831 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17967-201ENSMUST00000195319 647 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC154527.5-201ENSMUST00000224448 496 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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