Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm6445-201ENSMUST00000189515 1112 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm7073-202ENSMUST00000166562 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Zbed3Q9D0L1 Lrrd1-201ENSMUST00000044039 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm9947-202ENSMUST00000187401 687 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Zbed3Q9D0L1 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms