Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm14881-201ENSMUST00000120366 372 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Ccdc47Q9D024 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r139-201ENSMUST00000169730 894 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r112-201ENSMUST00000174538 894 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r157-201ENSMUST00000178215 894 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r132-201ENSMUST00000098736 894 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Ccdc47Q9D024 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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