Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Vwa5a-201ENSMUST00000001544 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 4933406D12Rik-201ENSMUST00000147212 737 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gbp2-ps-201ENSMUST00000198870 1269 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm46997-201ENSMUST00000222108 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Fam126b-207ENSMUST00000161600 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Smg8Q8VE18 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms