Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps126-201ENSMUST00000176711 1149 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms