Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1265-202ENSMUST00000214855 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm21033-201ENSMUST00000208590 2608 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
NipblQ6KCD5 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
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