Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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Sft2d1Q5SSN7 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Mir129-2-201ENSMUST00000083577 90 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Sft2d1Q5SSN7 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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