Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Rpl31-ps5-201ENSMUST00000118086 375 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Apc-ps1-201ENSMUST00000119356 470 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Rpl12-ps2-201ENSMUST00000121298 321 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 CT010506.3-201ENSMUST00000223699 410 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Tex38-201ENSMUST00000106521 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Cc2d2b-203ENSMUST00000207801 3730 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms