Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Zmym2-202ENSMUST00000223669 1281 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Olfr689-201ENSMUST00000098153 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
1700066B19RikQ3TS39 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm32281-202ENSMUST00000217220 691 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
1700066B19RikQ3TS39 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms