Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Shroom4Q1W617 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Scgb2b9-ps-201ENSMUST00000189522 334 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm42818-201ENSMUST00000198869 987 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Shroom4Q1W617 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms