Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ear-ps10-201ENSMUST00000161871 460 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r80-202ENSMUST00000227205 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm11219-201ENSMUST00000118565 358 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm42758-201ENSMUST00000202146 283 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14936-201ENSMUST00000137765 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1037-204ENSMUST00000216886 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm12914-201ENSMUST00000148635 305 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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