Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm43662-201ENSMUST00000198310 2271 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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ptchd1Q14B62 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
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ptchd1Q14B62 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ptchd1Q14B62 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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