Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
Hoxd1Q01822 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Hoxd1Q01822 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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