Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SbdsP70122 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC126673.3-201ENSMUST00000223414 3829 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Vmn1r49-202ENSMUST00000203791 1356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Igkv13-80-1-201ENSMUST00000197926 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 AC130823.2-201ENSMUST00000226169 290 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 C630028M04Rik-201ENSMUST00000141452 3387 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SbdsP70122 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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