Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr1355-201ENSMUST00000078414 3317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm31849-201ENSMUST00000220306 375 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm26733-201ENSMUST00000180846 2046 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrprbP47758 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
SrprbP47758 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms