Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Sprr2h-201ENSMUST00000059845 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm17976-201ENSMUST00000184037 1909 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Vmn2r-ps114-201ENSMUST00000177016 1280 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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Rpl28P41105 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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Rpl28P41105 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
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