Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RxraP28700 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RxraP28700 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RxraP28700 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RxraP28700 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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