Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr1114-ps1-201ENSMUST00000213896 456 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm43889-201ENSMUST00000203950 3681 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 AC166358.6-201ENSMUST00000221834 1206 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr1049-202ENSMUST00000216185 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Spta1P08032 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Spta1P08032 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Spta1P08032 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Spta1P08032 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Spta1P08032 Gm43892-201ENSMUST00000204373 265 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Spta1P08032 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Spta1P08032 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Spta1P08032 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Spta1P08032 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.8 ms