Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm14753-201ENSMUST00000118503 246 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm25666-201ENSMUST00000157702 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
F11rO88792 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm9308-201ENSMUST00000119073 448 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.55□□□□□ -2
F11rO88792 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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