Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 4930522H14Rik-201ENSMUST00000082306 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC3.96□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Casp12-201ENSMUST00000027009 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
Grik3B1AS29 Tbx22-201ENSMUST00000068451 2947 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps152-201ENSMUST00000176452 699 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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Grik3B1AS29 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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Grik3B1AS29 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
Grik3B1AS29 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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