Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Rps15a-ps3-201ENSMUST00000121072 395 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm44615-201ENSMUST00000206548 358 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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