Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

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Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 CT030135.1-201ENSMUST00000223760 570 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Mir3087-201ENSMUST00000199405 56 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm7588-201ENSMUST00000216866 571 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm5724-201ENSMUST00000148411 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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