Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm18540-201ENSMUST00000204025 526 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Zfp644-201ENSMUST00000045466 5569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Limd1Q9QXD8 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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