Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 AL929285.1-201ENSMUST00000215522 229 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Cln8Q9QUK3 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm27942-201ENSMUST00000184669 101 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Cln8Q9QUK3 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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