Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Rabgef1Q9JM13 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm16060-201ENSMUST00000153140 478 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Arhgef6-202ENSMUST00000114735 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14697-201ENSMUST00000147144 648 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm28840-205ENSMUST00000189320 615 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Glud-ps-201ENSMUST00000206310 657 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm38253-201ENSMUST00000194058 4678 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Olfr753-ps1-204ENSMUST00000219487 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Senp7-202ENSMUST00000089360 4802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
Rabgef1Q9JM13 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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