Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm29556-201ENSMUST00000187591 696 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm43853-201ENSMUST00000197162 301 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm24306-201ENSMUST00000180229 79 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 AC174082.1-201ENSMUST00000221106 307 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Usp15-211ENSMUST00000220377 11525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
RabggtaQ9JHK4 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms