Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr1208-201ENSMUST00000099810 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm28959-201ENSMUST00000186713 551 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SgshQ9EQ08 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SgshQ9EQ08 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms