Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm19786-201ENSMUST00000222589 580 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Rprd1bQ9CSU0 Gm9597-202ENSMUST00000227632 1387 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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