Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Use1Q9CQ56 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms