Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ubxn4Q8VCH8 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ubxn4Q8VCH8 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms