Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm37972-201ENSMUST00000193497 379 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm33819-201ENSMUST00000194008 1221 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Igkv7-33-201ENSMUST00000103376 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 AC116557.1-201ENSMUST00000219494 1521 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm7133-201ENSMUST00000187797 2039 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Zfp72-201ENSMUST00000091481 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Rbbp4Q60972 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms