Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm23415-201ENSMUST00000175519 83 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm24281-201ENSMUST00000104234 136 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Zfp965-201ENSMUST00000109002 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm11393-201ENSMUST00000118019 288 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Trappc1Q5NCF2 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Trappc1Q5NCF2 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm23599-201ENSMUST00000157261 251 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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Trappc1Q5NCF2 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm36974-201ENSMUST00000194200 1071 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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