Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm26289-201ENSMUST00000104169 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm12732-201ENSMUST00000121688 180 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm23044-201ENSMUST00000157891 100 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Ifi206-202ENSMUST00000169797 429 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm40190-201ENSMUST00000196570 471 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rnf40Q3U319 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm22714-201ENSMUST00000116894 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm12573-201ENSMUST00000118158 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm14842-201ENSMUST00000119577 269 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm6872-201ENSMUST00000165001 700 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm17201-201ENSMUST00000167226 390 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Scgb1b5-ps-201ENSMUST00000189491 280 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Calml4-204ENSMUST00000214633 394 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rnf40Q3U319 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms