Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 4930420N18Rik-201ENSMUST00000191831 676 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC154594.1-201ENSMUST00000225171 1273 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.78
Trim71Q1PSW8 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 AC124572.2-201ENSMUST00000218041 5152 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
Trim71Q1PSW8 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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