Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr847-201ENSMUST00000079620 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm6545-201ENSMUST00000217186 1786 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm8942-201ENSMUST00000217892 400 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Vmn2r-ps82-201ENSMUST00000174222 1641 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm45588-201ENSMUST00000211213 630 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 Gm7751-201ENSMUST00000212868 709 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Rpl28P41105 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms