Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm9958-201ENSMUST00000068250 1284 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PtprmP28828 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
PtprmP28828 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PtprmP28828 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PtprmP28828 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PtprmP28828 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PtprmP28828 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PtprmP28828 AC154635.1-201ENSMUST00000221433 400 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PtprmP28828 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PtprmP28828 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm6639-202ENSMUST00000196841 2666 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Cwf19l2-201ENSMUST00000027027 4446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 Gm44277-201ENSMUST00000205128 649 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PtprmP28828 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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