Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm30034-201ENSMUST00000219589 248 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtpraP18052 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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