Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr1224-ps1-206ENSMUST00000216976 2019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
DffaO54786 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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