Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr744-201ENSMUST00000066457 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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Nedd9O35177 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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Nedd9O35177 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm5347-201ENSMUST00000210542 2327 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Oog2-201ENSMUST00000080405 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Nedd9O35177 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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