Protein–RNA interactions for Protein: F6U8V3

H2-M11, Histocompatibility 2, M region locus 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M11F6U8V3 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 AC167250.1-201ENSMUST00000213739 3813 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
H2-M11F6U8V3 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms