Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Ccdc9bA3KGF9 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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