Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Atp8b5A3FIN4 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 1700020G17Rik-204ENSMUST00000191429 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Vmn2r78-201ENSMUST00000170835 2611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Atp8b5A3FIN4 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms