Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr919-201ENSMUST00000071425 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CtcflA2APF3 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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