Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm3145-201ENSMUST00000188584 220 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1226-203ENSMUST00000215562 2669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Btbd35f7-201ENSMUST00000105007 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm20468-201ENSMUST00000172664 452 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm28702-201ENSMUST00000188276 253 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Calml4-203ENSMUST00000213643 710 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm8672-201ENSMUST00000221200 332 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 1700112M02Rik-201ENSMUST00000221719 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 AC155237.2-201ENSMUST00000228487 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Lpar4-201ENSMUST00000060576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 6720427I07Rik-201ENSMUST00000181490 2300 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm37802-201ENSMUST00000194998 2643 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Cnot7-203ENSMUST00000132032 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hdac6Q9Z2V5 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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