Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm38020-201ENSMUST00000193066 4676 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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Usp18Q9WTV6 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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Usp18Q9WTV6 A530099J19Rik-201ENSMUST00000151029 2764 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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Usp18Q9WTV6 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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Usp18Q9WTV6 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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Usp18Q9WTV6 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Usp18Q9WTV6 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms