Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Col4a3Q9QZS0 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm18026-201ENSMUST00000222789 727 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr887-202ENSMUST00000212502 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm21990-201ENSMUST00000124692 383 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm42828-201ENSMUST00000199669 469 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm7117-201ENSMUST00000071515 387 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Fbxw14-201ENSMUST00000112041 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col4a3Q9QZS0 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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