Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm20826-202ENSMUST00000185348 4605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Arhgap12-202ENSMUST00000077128 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ska2l-ps-201ENSMUST00000186208 360 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm22468-201ENSMUST00000116680 120 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm26248-201ENSMUST00000116700 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm26137-201ENSMUST00000116701 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm26190-201ENSMUST00000116704 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Limd1Q9QXD8 Gm23177-201ENSMUST00000116784 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm24193-201ENSMUST00000116801 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm24744-201ENSMUST00000116833 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm24427-201ENSMUST00000116896 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm22346-201ENSMUST00000116918 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm23606-201ENSMUST00000116938 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm22029-201ENSMUST00000116940 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm26298-201ENSMUST00000116956 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm23844-201ENSMUST00000116959 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm24484-201ENSMUST00000117009 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm25347-201ENSMUST00000117026 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm22112-201ENSMUST00000117032 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm22991-201ENSMUST00000178126 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm25754-201ENSMUST00000178653 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm22419-201ENSMUST00000178780 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm24802-201ENSMUST00000178897 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm25208-201ENSMUST00000178964 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm24567-201ENSMUST00000179294 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm23943-201ENSMUST00000179712 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm25228-201ENSMUST00000180121 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Limd1Q9QXD8 Gm23304-201ENSMUST00000180209 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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